Le bassin de la Vilaine est géré dans son ensemble par le SAGE Vilaine (Schéma d’Aménagement et de Gestion des Eaux de la Vilaine), tant sur le plan de l’eau que sur celui de l’environnement. La Vilaine traversant plusieurs départements, il a été créé des comités de gestion par secteur au sein du SAGE Vilaine.
En ce qui concerne Arzal, il s’agit du Comité d’Estuaire, avec pour rôle :
- bilan hydraulique et indicateurs de qualité de l’eau de la Vilaine en amont du barrage
- problèmes d’envasement et surveillance des zones de protection des coquillages, en aval.
Un groupe de travail constitué d’élus, d’usagers et de représentants d’associations de défense de l’environnement et des administrations, travaille sur le dossier de l’envasement et recherche des solutions envisageables pour stabiliser le phénomène voire même réduire le volume actuellement constaté.